1.中性蛋白酶在焙烤行业领域用于制作饼干，可减少面团的混合时间和发酵时间，通过蛋白酶生物活性物质的酶促反应，将面团的蛋白质水解成胨、肽类甚至氨基酸，减弱面团筋力，使它具有良好的可塑性和延伸性，保持清晰美观的印花图案。改善成品的光泽、使饼干断面层次分明，结构均匀一致，口感松爽酥脆。
2.用于酒精工业及酿造工业。
3.工业上应用于啤酒生产可使大麦汁中的蛋白质分解作用加强，可达到良好的澄清效果,有利于啤酒的风味和提高泡沫非生物稳定性等。
4.饲料工业的应用：
加入饲料配方中或直接与混合饲料混合饲喂，可提高蛋白质的利用率和降低饲养成本。
